本書共分為三個部分,即基礎篇、免疫篇與感染篇。第一部份主要討論微生物的構造功能與生長代謝、消毒與滅菌的基本概念與方法、抗生素使用與抗藥性的傳播。
第二部分說明免疫學,它涵蓋著基本概念---「我」與「非我」的不同、「特異」與「非特異」間的界別、「正常」與「異常」的區分;內容則包括免疫系統、過敏反應、自體免疫疾病三個專章。
第三部分則是與臨床有關的傳染病,書中按照組織與系統,將常見的微生物感染症分門別類地加以敘述,亦將病原菌化整為零地放在各章中說明(不似一般書籍以微生物為主地描述疾病),其目的除了使同學於再次學習微生物學時仍有新鮮感外,更重要的是期盼能將臨床的實際情景與書本的理論知識相配合。